NBRP基盤技術整備プログラムで整備した
広範な微生物株の MALDI-TOF MS レファレンスライブラリー
JCM, IFM, GTC, NEKKEN* では合同で、広範な微生物株を対象としたMALDI-TOF MSレファレンスライブラリー ‘EMALiMB’ (Expanded MALDI-TOF MS Library for MALDI Biotyper®)を新規に構築しました。下記リンクのファイル(.btmsp)をダウンロードし、ソフトウェアにインポートすることでレファレンスとしてご利用いただけます(Bruker社MALDI Biotyper®に対応)。なお、お使いのPC環境により、容量が大きい .btmsp ファイルのインポートではエラーが発生することがあります。
収載されている菌株のリストは、
こちらからダウンロードできます。
EMALiMB_NBRP_Library_ver3.1 では、JCMとIFMが保存する真菌リソース 2,000件、JCMとGTCが保存するバクテリアリソース 約 1,140件、NEKKENが保存するTrypanosomaを含む原虫リソース14件などのMALDI-TOF MSデータを収載しています。EMALiMB_NBRP_Library_ver3.1 には健康の研究に役立つ乳酸菌や腸内細菌をはじめとする嫌気性細菌のデータが多く含まれます。なお、ver3.1 は ver3.0 までのデータを含んでおります。
本プロジェクトは、文部科学省の主導するナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)基盤技術整備プログラムの助成を受けて2020-2021年度に実施したもので、継続的にMALDI-TOF MSデータを追加しています。微生物株は、JCM, IFM, GTC, NEKKENの各機関から提供しております 。
* JCM: 理化学研究所バイオリソース研究センター微生物材料開発室
IFM: 千葉大学真菌医学研究センター微生物資源分野バイオリソース管理室
GTC: 岐阜大学 高等研究院科学研究基盤センター嫌気性菌研究分野
NEKKEN: 長崎大学熱帯医学研究所
| Taxonomy
| EMALiMB ver3.1 (updated on Oct. 1, 2026)
|
| All |
3,170 MSPs |
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| Bacteria |
1,142 MSPs |
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| Bacillati |
763 MSPs |
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| Actinomycetota |
202 MSPs |
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| Actinomycetes |
180 MSPs |
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| Coriobacteriia |
22 MSPs |
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| Bacillota |
561 MSPs |
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| Bacilli |
296 MSPs |
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| Caryophanales (Bacillales) |
61 MSPs |
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| Lactobacillales |
235 MSPs |
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| Aerococcaceae |
3 MSPs |
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| Carnobacteriaceae |
5 MSPs |
|
| Enterococcaceae |
9 MSPs |
|
| Lactobacillaceae |
184 MSPs |
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| Streptococcaceae |
34 MSPs |
|
| Clostridia |
196 MSPs |
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| Eubacteriales |
98 MSPs |
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| Lachnospirales |
67 MSPs |
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| Peptostreptococcales |
31 MSPs |
|
| Erysipelotrichia |
25 MSPs |
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| Negativicutes |
27 MSPs |
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| Tissierellia |
17 MSPs |
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| Fusobacteriati |
4 MSPs |
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| Fusobacteriota |
4 MSPs |
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| Pseudomonadati |
373 MSPs |
 |
| Bacteroidota |
183 MSPs |
|
| Bacteroidia |
162 MSPs |
|
| Chitinophagia |
11 MSPs |
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| Cytophagia |
1 MSPs |
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| Flavobacteriia |
1 MSPs |
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| Sphingobacteriia |
8 MSPs |
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| Campylobacterota |
21 MSPs |
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| Lentisphaerota |
2 MSPs |
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| Myxococcota |
4 MSPs |
|
| Pseudomonadota |
154 MSPs |
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| Thermodesulfobacteriota |
3 MSPs |
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| Verrucomicrobiota |
6 MSPs |
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| Thermotogati |
2 MSPs |
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| Synergistota |
2 MSPs |
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| |
| Fungi |
2,000 MSPs |
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| Ascomycota |
1,319 MSPs |
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| Ascomycota incertae sedis |
1 MSPs |
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| Saccharomyceta |
1,287 MSPs |
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| Pezizomycotina |
234 MSPs |
 |
| Saccharomycotina |
1,053 MSPs |
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| Dipodascomycetes |
199 MSPs |
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| Lipomycetes |
23 MSPs |
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| Pichiomycetes |
570 MSPs |
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| Alaninales |
15 MSPs |
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| Pichiales |
157 MSPs |
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| Serinales |
398 MSPs |
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| Cephaloascaceae |
1 MSPs |
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| Debaryomycetaceae |
354 MSPs |
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| Candida/Lodderomyces clade |
73 MSPs |
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| Other clades |
281 MSPs |
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| Metschnikowiaceae |
42 MSPs |
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| Serinales incertae sedis |
1 MSPs |
|
| Saccharomycetes |
251 MSPs |
 |
| Sporopachydermiomycetes |
8 MSPs |
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| Trigonopsidomycetes |
2 MSPs |
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| Taphrinomycotina |
31 MSPs |
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| Basidiomycota |
660 MSPs |
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| Agaricomycotina |
390 MSPs |
 |
| Agaricomycetes |
52 MSPs |
|
| Tremellomycetes |
338 MSPs |
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| Cystofilobasidiales |
41 MSPs |
|
| Filobasidiales |
51 MSPs |
|
| Holtermanniales |
2 MSPs |
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| Tremellales |
131 MSPs |
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| Trichosporonales |
113 MSPs |
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| Pucciniomycotina |
203 MSPs |
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| Ustilaginomycotina |
66 MSPs |
 |
| Wallemiomycotina |
1 MSPs |
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| Mucoromycota |
21 MSPs |
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| Prototheca |
14 MSPs |
 |
| Protozoa |
14 MSPs |
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