JCM BLAST検索では、クエリ配列と相同性のあるゲノム配列をもつJCM株（もしくは同等株）を検索することができます。
以下の５つのBLASTプログラムがご利用可能です。
| プログラム | クエリ | データベース |
| blastn | 塩基配列 | 塩基配列 |
| blastp | アミノ酸配列 | アミノ酸配列 |
| blastx | 塩基配列 | アミノ酸配列 |
| tblastn | アミノ酸配列 | 塩基配列 |
| tblastx | 塩基配列 | 塩基配列 |
クエリ配列（FASTA形式）をテキストボックスに入力してください。もしくはクエリ配列が入力されたテキストファイルをアップロードしてください。
注：クエリ配列は５つまでです。また、N以外の混合塩基（RやYなど）には対応しておりません。N以外の混合塩基がクエリ配列に含まれる場合は、すべてNに置換してから検索を開始してください。
クエリ配列の例：
| 塩基配列 |
| >Query nucleotide sequence atgcgaagtgaacagatttctggctcgtcactcaatccgtcttgtcgtttcagttctgcgtactctcctgtgaccaggcagcgaaaagacatgagtcgatga |
| アミノ酸配列 |
| >Query protein sequence MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVTLKEGQNLDFVGGAE |
以下のデータベースから選んでください。
| データベースの選択 | 対象領域 | データベース元* | 配列の種類 |
| Genome sequence (GenBank; nucleotide) | ゲノム配列全体 | GenBank | 塩基配列 |
| Coding sequence (GenBank; nucleotide) | タンパク質をコードした遺伝子領域のみ | GenBank | 塩基配列 |
| Coding sequence (RefSeq; nucleotide) | タンパク質をコードした遺伝子領域のみ | RefSeq | 塩基配列 |
| Coding sequence (GenBank; protein) | タンパク質をコードした遺伝子領域のみ | GenBank | アミノ酸配列 |
| Coding sequence (RefSeq; protein) | タンパク質をコードした遺伝子領域のみ | RefSeq | アミノ酸配列 | *データベースには原核生物ゲノムのみ含まれます。RefSeqとGenBankの違いについてはこちらを参照 |
データベース最終更新日: 2024年8月20日
必要に応じて、Advanced Parameters の値を調整してください。
（注：結果が表示されるまでウインドウを閉じたり、戻るボタンを押さないでください。）
表示されたJCM番号をクリックすると、カタログページにジャンプします。
（注：検索結果は、リファレンスデータベースに依存しますので、JCM株のゲノム中の検索配列の有無を保証するものではありません。）
不具合等ございましたら、こちらのフォームよりお知らせください。
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