PAGE TOP
Genome sequencing of JCM strains under the NBRP program (Eukaryotic microbes)
JCM determined draft genome sequences of various strains of fungi and related species listed below, in collaboration with Division of Genomic Technologies, RIKEN Center for Life Science Technologies. The genome sequencing project was supported by the FY2014 Genome Information Upgrading Program of National BioResource Project (NBRP) of the MEXT, Japan. The sequenced microbial strains and their genome DNAs are available from RIKEN BRC-JCM and RIKEN BRC-DNA Bank, respectively. The organisms within a subphylum are listed alphabetically.
 
Domain Eukaryota
 
Saccharomycotina
Ascomycota
Pezizomycotina
Ustilaginomycotina
Basidiomycota Pucciniomycotina
Agaricomycotina
Early-divergent lineages (Zygomycota)
Chlorophyta (Prototheca)
Stramenopiles (Pilasporangium)
 
(*,"-(hyphen)" indicates that data preparation is in progress)
    Scientific name   online catalog
JCM no.
  Summary*   Download*   BioProject ID   DNA available
JGD no.
   
Ascomycota
     
Saccharomycotina
      Ambrosiozyma monospora   JCM 7599       PRJDB3677   JGD13861
  Ascoidea asiatica   JCM 7603       PRJDB3724   JGD13903
    Ascoidea hylecoeti   JCM 7604       PRJDB3734   JGD13782
      Candida boidinii   JCM 9604       PRJDB3623   JGD12265
    Candida carpophila   JCM 9396       PRJDB3618   JGD13804
  Candida homilentoma   JCM 1507       PRJDB3610   JGD13795
    Candida intermedia   JCM 1607       PRJDB3612   JGD13797
    Candida kashinagacola   JCM 15019       PRJDB3608   JGD13793
    Candida peltata   JCM 9829       PRJDB3624   JGD13809
  Candida sorboxylosa   JCM 1536       PRJDB3611   JGD13796
    Candida sp.   JCM 15000   -   -   PRJDB3781   JGD13792
    Candida succiphila   JCM 9445       PRJDB3619   JGD13805
    Candida versatilis   JCM 5958       PRJDB3712   JGD13891
    Cyberlindnera fabianii   JCM 3601       PRJDB3616   JGD13802
  Millerozyma acaciae   JCM 10732       PRJDB3722   JGD13901
    Ogataea methanolica   JCM 10240       PRJDB3731   JGD13907
  Priceomyces haplophilus   JCM 1635       PRJDB3667   JGD13851
      Saccharomycopsis malanga   JCM 7620       PRJDB3617   JGD13803
    Scheffersomyces lignosum   JCM 9837       PRJDB3626   JGD13811
      Sporopachydermia quercuum   JCM 9486       PRJDB3621   JGD13807
    Starmerella bombicola   JCM 9596       PRJDB3622   JGD13808
    Wickerhamia fluorescens   JCM 1821       PRJDB3613   JGD13798
    Wickerhamiella domercqiae   JCM 9478       PRJDB3620   JGD13806
  Yarrowia deformans   JCM 1694       PRJDB3684   JGD13868
    Yarrowia keelungensis   JCM 14894       PRJDB3795   JGD13875
      Yarrowia sp.   JCM 30694       PRJDB3798   JGD13777
      Yarrowia sp.   JCM 30695       PRJDB3800   JGD13781
      Yarrowia sp.   JCM 30696       PRJDB3799   JGD13778
     
Pezizomycotina
      Acremonium furcatum   JCM 9210       PRJDB3662   JGD13845
    Acremonium tumulicola   JCM 17184       PRJDB3659   JGD13765
      Arthrinium pseudosinense   JCM 6018   -   -   PRJDB3638   JGD13822
    Aspergillus awamori var. piceus   JCM 22320       PRJDB3628   JGD13814
      Aspergillus fumigatus var. fumigatus   JCM 10253       PRJDB3633   JGD13818
      Basipetospora chlamydospora   JCM 23157       PRJDB3651   JGD13836
      Ceratocystis paradoxa   JCM 6961       PRJDB3606   JGD13790
      Chaetomella raphigera   JCM 9995   -   -   PRJDB3630   JGD13816
      Chalara paradoxa   JCM 6020       PRJDB3645   JGD13830
    Chalara thielavioides   JCM 1933       PRJDB3629   JGD13815
    Eurotium chevalieri   JCM 23047       PRJDB3666   JGD13850
      Exophiala alcalophila   JCM 1751       PRJDB3660   JGD13843
      Exophiala calicioides   JCM 6030       PRJDB3661   JGD13844
      Exophiala spinifera   JCM 15939       PRJDB3639   JGD13823
      Fusarium oxysporum   JCM 11502       PRJDB3637   JGD13821
      Memnoniella echinata   JCM 22618       PRJDB3641   JGD13826
      Penicillium citrinum   JCM 22607   -   -   PRJDB3737   JGD13825
      Penicillium roqueforti   JCM 22842       PRJDB3665   JGD13848
      Pestalotiopsis sp.   JCM 9685       PRJDB3782   JGD13799
      Phoma herbarum   JCM 15942       PRJDB3625   JGD13810
      Raffaelea quercivora   JCM 11526   -   -   PRJDB3607   JGD13791
    Ulocladium consortiale   JCM 1940   -   -   PRJDB3614   JGD13800
     
Unclassified
      Albophoma yamanashiensis   JCM 11844       PRJDB3823   JGD13827
      Beverwykella pulmonaria   JCM 9230       PRJDB3643   JGD13828
      Didymobotryum rigidum   JCM 8837       PRJDB3824   JGD13849
      Endocalyx cinctus   JCM 7946       PRJDB3783   JGD13813
    Symbiotaphrina buchneri   JCM 9740       PRJDB3668   JGD13852
   
Basidiomycota
     
Ustilaginomycotina
      Farysizyma acheniorum   JCM 8976   -   -   PRJDB3653   JGD13838
  Malassezia dermatis   JCM 11348       PRJDB3732   JGD13783
      Malassezia japonica   JCM 11963       PRJDB3733   JGD13908
    Malassezia nana   JCM 12085       PRJDB3735   JGD13909
    Meira nashicola   JCM 18503       PRJDB3711   JGD13780
      Rhodotorula bacarum   JCM 3928   -   -   PRJDB3649   JGD13834
      Rhodotorula phylloplana   JCM 9035   -   -   PRJDB3654   JGD13839
    Sympodiomycopsis paphiopedili   JCM 8318   -   -   PRJDB3652   JGD13837
      Tilletiopsis pallescens   JCM 5230       PRJDB3650   JGD13835
    Ustilago maydis   JCM 2005       PRJDB3636   JGD13820
     
Pucciniomycotina
    Bensingtonia subrosea   JCM 5735   -   -   PRJDB3675   JGD13859
      Kondoa malvinella   JCM 3789   -   -   PRJDB3674   JGD13858
    Leucosporidiella creatinivora   JCM 10699       PRJDB3719   JGD13898
      Rhodosporidium toruloides   JCM 10020       PRJDB3686   JGD13870
      Rhodosporidium toruloides   JCM 10021       PRJDB3687   JGD13871
      Rhodosporidium toruloides   JCM 10049       PRJDB3688   JGD13872
      Rhodosporidium toruloides   JCM 24501       PRJDB3691   JGD13772
    Rhodotorula pallida   JCM 3780       PRJDB3673   JGD13857
    Sporobolomyces carnicolor   JCM 3766   -   -   PRJDB3648   JGD13833
    Sporobolomyces lactophilus   JCM 7595       PRJDB3676   JGD13860
      Sporobolomyces yunnanensis   JCM 10687       PRJDB3690   JGD13874
     
Agaricomycotina
  Asterotremella humicola   JCM 1457       PRJDB3692   JGD13876
    Bullera koratensis   JCM 12878   -   -   PRJDB3728   JGD13904
      Bulleromyces albus   JCM 2954       PRJDB3685   JGD13869
    Cryptococcus albidus   JCM 2334       PRJDB3657   JGD13841
      Cryptococcus curvatus   JCM 1532       PRJDB3694   JGD13877
    Cryptococcus fagi   JCM 13614       PRJDB3656   JGD13784
    Cryptococcus phenolicus   JCM 11743       PRJDB3680   JGD13864
    Cryptococcus skinneri   JCM 9039       PRJDB3655   JGD13840
    Cryptococcus sp.   JCM 24511       PRJDB3825   JGD13768
      Cryptococcus tepidarius   JCM 11965   -   -   PRJDB3726   JGD13766
    Cryptococcus terricola   JCM 24518       PRJDB3736   JGD13769
    Cryptococcus wieringae   JCM 11695       PRJDB3683   JGD13867
  Dioszegia aurantiaca   JCM 2956       PRJDB3721   JGD13900
      Dioszegia crocea   JCM 2961       PRJDB3718   JGD13897
  Filobasidium capsuligenum   JCM 9041   -   -   PRJDB3700   JGD13883
    Filobasidium elegans   JCM 10632   -   -   PRJDB3705   JGD13888
    Filobasidium globisporum   JCM 10633   -   -   PRJDB3706   JGD13889
  Filobasidium uniguttulatum   JCM 3685   -   -   PRJDB3699   JGD13882
    Guehomyces pullulans   JCM 9886   -   -   PRJDB3678   JGD13862
      Holtermannia corniformis   JCM 1743       PRJDB3671   JGD13855
    Holtermanniella nyarrowii   JCM 11471       PRJDB3681   JGD13865
    Kendrickiella phycomyces   JCM 18027   -   -   PRJDB3631   JGD13764
    Lyophyllum decastes   JCM 30590   -   -   PRJDB3707   JGD13773
      Lyophyllum shimeji   JCM 30591   -   -   PRJDB3708   JGD13774
      Mrakia frigida   JCM 7857       PRJDB3713   JGD13892
      Mrakiella aquatica   JCM 1775   -   -   PRJDB3647   JGD13832
      Schizophyllum commune   JCM 22674       PRJDB3635   JGD13770
      Tausonia pamirica   JCM 10408   -   -   PRJDB3689   JGD13873
      Thermoascus crustaceus   JCM 12817       PRJDB3664   JGD13847
      Tremella foliacea   JCM 11330   -   -   PRJDB3658   JGD13842
      Trichoderma atroviride   JCM 9410       PRJDB3574   JGD13789
    Trichoderma longibrachiatum   JCM 1883   -   -   PRJDB3615   JGD13801
    Trichosporon brassicae   JCM 1599       PRJDB3695   JGD13878
      Trichosporon cutaneum   JCM 1462       PRJDB3729   JGD13905
  Trichosporon domesticum   JCM 9580       PRJDB3573   JGD13788
    Trichosporon gamsii   JCM 9941       PRJDB3703   JGD13886
    Trichosporon gracile   JCM 10018       PRJDB3704   JGD13887
    Trichosporon guehoae   JCM 10690       PRJDB3714   JGD13893
      Trichosporon laibachii   JCM 2947       PRJDB3730   JGD13906
      Trichosporon montevideense   JCM 9937       PRJDB3572   JGD13787
    Trichosporon porosum   JCM 1458       PRJDB3693   JGD13785
    Trichosporon veenhuisii   JCM 10691       PRJDB3717   JGD13896
    Udeniomyces megalosporus   JCM 5269   -   -   PRJDB3720   JGD13899
    Udeniomyces piricola   JCM 2958   -   -   PRJDB3672   JGD13856
  Xanthophyllomyces dendrorhous   JCM 9681       PRJDB3716   JGD13895
   
Early-divergent lineages (Zygomycota)
     
Mucoromycotina
      Actinomucor elegans   JCM 22485       PRJDB3646   JGD13831
    Mucor circinelloides   JCM 22480       PRJDB3642   JGD13771
   
Chlorophyta (Achlorophyllic yeast-like alga)
    Prototheca cutis   JCM 15793   -   -   PRJDB3669   JGD13853
    Prototheca stagnora   JCM 9641   -   -   PRJDB3715   JGD13894
   
Stramenopiles (Oomycetes)
      Pilasporangium apinafurcum   JCM 30513       PRJDB3796   JGD13775
      Pilasporangium apinafurcum   JCM 30514       PRJDB3797   JGD13776